Sukad sa pagkadiskobre niini sa Djibouti niadtong 2012, ang lamok nga Asian Anopheles stephensi mikaylap na sa tibuok Horn of Africa. Kini nga invasive vector nagpadayon sa pagkaylap sa tibuok kontinente, nga naghatag ug seryosong hulga sa mga programa sa pagkontrol sa malaria. Ang mga pamaagi sa pagkontrol sa vector, lakip ang mga bed nets nga gitambalan og insecticide ug indoor residual spraying, nakapakunhod pag-ayo sa palas-anon sa malaria. Bisan pa, ang nagkadaghang pagkaylap sa mga lamok nga resistensyado sa insecticide, lakip ang mga populasyon sa Anopheles stephensi, nakababag sa nagpadayon nga mga paningkamot sa pagwagtang sa malaria. Ang pagsabot sa istruktura sa populasyon, pag-agos sa gene tali sa mga populasyon, ug ang pag-apod-apod sa mga mutasyon nga resistensya sa insecticide hinungdanon aron magiyahan ang epektibo nga mga estratehiya sa pagkontrol sa malaria.
Ang pagpalambo sa atong pagsabot kon giunsa pag-establisar ang An. stephensi sa HOA hinungdanon sa pagtagna sa potensyal nga pagkaylap niini sa bag-ong mga lugar. Ang genetics sa populasyon gigamit pag-ayo sa pagtuon sa mga vector species aron makakuha og panabut sa istruktura sa populasyon, padayon nga pagpili, ug pag-agos sa gene18,19. Alang sa An. stephensi, ang pagtuon sa istruktura sa populasyon ug istruktura sa genome makatabang sa pagpatin-aw sa ruta sa pagsulong niini ug bisan unsang adaptive evolution nga mahimong nahitabo sukad sa pagtungha niini. Gawas pa sa pag-agos sa gene, ang pagpili labi ka hinungdanon tungod kay kini makaila sa mga alleles nga nalangkit sa resistensya sa insecticide ug maghatag kahayag kon giunsa pagkaylap kini nga mga alleles sa populasyon20.
Hangtod karon, ang pagsulay sa mga marker sa resistensya sa insecticide ug genetics sa populasyon sa invasive species nga Anopheles stephensi limitado lamang sa pipila ka mga kandidato nga gene. Ang pagtungha sa species sa Africa wala pa hingpit nga masabtan, apan usa ka hypothesis mao nga kini gidala sa mga tawo o mga kahayupan. Ang ubang mga teorya naglakip sa long distance migration pinaagi sa hangin. Ang mga Ethiopian isolates nga gigamit niini nga pagtuon gikolekta sa Awash Sebat Kilo, usa ka lungsod nga nahimutang 200 km sa sidlakan sa Addis Ababa ug sa main transport corridor gikan sa Addis Ababa hangtod sa Djibouti. Ang Awash Sebat Kilo usa ka lugar nga adunay taas nga transmission sa malaria ug adunay daghang populasyon sa Anopheles stephensi, nga gitaho nga resistensyado sa mga insecticide, nga naghimo niini nga usa ka importante nga lugar alang sa pagtuon sa genetics sa populasyon sa Anopheles stephensi8.
Ang mutasyon sa resistensya sa insecticide nga kdr L1014F nakita sa ubos nga frequency sa populasyon sa Etiopia ug wala nakita sa mga sample sa uma sa India. Kini nga mutasyon sa kdr naghatag og resistensya sa mga pyrethroid ug DDT ug kaniadto nakita sa mga populasyon sa An. stephensi nga nakolekta sa India niadtong 2016 ug Afghanistan niadtong 2018.31,32 Bisan pa sa ebidensya sa kaylap nga resistensya sa pyrethroid sa duha ka siyudad, ang mutasyon sa kdr L1014F wala makita sa mga populasyon sa Mangalore ug Bangalore nga gisusi dinhi. Ang ubos nga proporsyon sa mga Ethiopian isolate nga nagdala niini nga SNP nga heterozygous nagsugyot nga ang mutasyon bag-o lang mitungha niini nga populasyon. Gisuportahan kini sa miaging pagtuon sa Awash nga wala’y nakit-an nga ebidensya sa kdr mutation sa mga sample nga nakolekta sa tuig sa wala pa ang mga gisusi dinhi.18 Nailhan na namo kaniadto kini nga kdr L1014F mutation sa ubos nga frequency sa usa ka hugpong sa mga sample gikan sa parehas nga rehiyon/tuig gamit ang pamaagi sa pag-detect sa amplicon.28 Tungod sa phenotypic resistance sa mga sampling site, ang ubos nga allele frequency niini nga resistance marker nagsugyot nga ang mga mekanismo gawas sa pag-usab sa target site ang responsable sa kini nga naobserbahan nga phenotype.
Usa ka limitasyon niini nga pagtuon mao ang kakulang sa phenotypic data sa insecticide response. Dugang nga mga pagtuon nga naghiusa sa whole genome sequencing (WGS) o targeted amplicon sequencing inubanan sa susceptibility bioassays ang gikinahanglan aron imbestigahan ang epekto niining mga mutasyon sa insecticide response. Kining mga nobela nga missense SNP nga mahimong nalangkit sa resistensya kinahanglan nga targeton alang sa high-throughput molecular assays aron suportahan ang pagmonitor ug mapadali ang functional work aron masabtan ug mapamatud-an ang potensyal nga mga mekanismo nga nalangkit sa resistance phenotypes.
Sa laktod nga pagkasulti, kini nga pagtuon naghatag ug mas lawom nga pagsabot sa genetics sa populasyon sa lamok nga Anopheles sa lain-laing mga kontinente. Ang paggamit sa whole genome sequencing (WGS) analysis sa mas dagkong mga cohort sa mga sample sa lain-laing mga rehiyon sa heyograpiya maoy yawe sa pagsabot sa gene flow ug pag-ila sa mga marker sa resistensya sa insecticide. Kini nga kahibalo makapahimo sa mga awtoridad sa panglawas sa publiko sa paghimo og mga desisyon nga may kahibalo sa vector surveillance ug paggamit sa insecticide.
Migamit mig duha ka pamaagi aron mamatikdan ang pagkalainlain sa gidaghanon sa kopya niini nga dataset. Una, migamit mig pamaagi nga nakabase sa coverage nga naka-focus sa nailhan nga mga cluster sa gene sa CYP sa genome (Supplementary Table S5). Ang coverage sa sample gi-average sa mga lokasyon sa koleksyon ug gibahin sa upat ka grupo: Ethiopia, mga umahan sa India, mga kolonya sa India, ug mga kolonya sa Pakistan. Ang coverage para sa matag grupo gi-normalize gamit ang kernel smoothing ug dayon gi-plot sumala sa median genome coverage depth para sa maong grupo.
Oras sa pag-post: Hunyo-23-2025