pangutana bg

Genome-wide population genetics ug molecular monitoring sa insecticide resistance sa Anopheles mosquitoes sa Sebatkilo, Awash, Ethiopia

Sukad sa pagkadiskobre niini sa Djibouti niadtong 2012, ang Asian Anopheles stephensi nga lamok mikaylap sa tibuok Horn of Africa. Kining invasive vector nagpadayon sa pagkaylap sa tibuok kontinente, nga naghatag ug seryoso nga hulga sa malaria control programs. Ang mga pamaagi sa pagkontrol sa vector, apil ang mga pukot nga giatiman sa insecticide ug ang nahabilin nga pag-spray sa sulod sa balay, nakamenus pag-ayo sa palas-anon sa malaria. Bisan pa, ang pagtaas sa pagkaylap sa mga lamok nga resistensya sa insecticide, lakip ang mga populasyon sa Anopheles stephensi, nakababag sa nagpadayon nga mga paningkamot sa pagwagtang sa malaria. Ang pagsabot sa istruktura sa populasyon, pag-agos sa gene tali sa mga populasyon, ug ang pag-apod-apod sa mga mutation sa resistensya sa insecticide kinahanglanon aron makagiya sa epektibo nga mga estratehiya sa pagkontrol sa malaria.
Pagpauswag sa atong pagsabot kung giunsa ni An. Ang stephensi nahimo nga naestablisar pag-ayo sa HOA hinungdanon sa pagtagna sa potensyal nga pagkaylap niini sa mga bag-ong lugar. Ang genetics sa populasyon kaylap nga gigamit sa pagtuon sa mga espisye sa vector aron makakuha og panabut sa istruktura sa populasyon, padayon nga pagpili, ug pagdagayday sa gene18,19. Alang kang An. stephensi, ang pagtuon sa istruktura sa populasyon ug istruktura sa genome makatabang sa pagpatin-aw sa ruta sa pagsulong niini ug sa bisan unsang adaptive evolution nga mahimong nahitabo sukad sa pagtungha niini. Dugang pa sa dagan sa gene, ang pagpili ilabinang importante tungod kay kini makaila sa mga alel nga nalangkit sa pagsukol sa insecticide ug naghatag ug kahayag kon sa unsang paagi kini nga mga alel mikaylap sa populasyon20.
Sa pagkakaron, ang pagsulay sa mga marka sa pagsukol sa insecticide ug genetics sa populasyon sa invasive species nga Anopheles stephensi limitado sa pipila ka mga kandidato nga gene. Ang pagtumaw sa mga espisye sa Africa dili hingpit nga masabtan, apan ang usa ka pangagpas mao nga kini gipaila sa mga tawo o kahayopan. Ang ubang mga teorya naglakip sa layo nga paglalin pinaagi sa hangin. Ang mga Etiopianhong isolates nga gigamit niini nga pagtuon gikolekta sa Awash Sebat Kilo, usa ka lungsod nga nahimutang 200 km silangan sa Addis Ababa ug sa main transport corridor gikan sa Addis Ababa ngadto sa Djibouti. Ang Awash Sebat Kilo usa ka lugar nga adunay taas nga transmission sa malaria ug adunay daghang populasyon sa Anopheles stephensi, nga gikataho nga dili makasugakod sa insecticides, nga naghimo niini nga usa ka hinungdanon nga lugar alang sa pagtuon sa genetics sa populasyon sa Anopheles stephensi8.
Ang mutation sa resistensya sa insecticide kdr L1014F nakit-an sa ubos nga frequency sa populasyon sa Etiopia ug wala makit-an sa mga sample sa kapatagan sa India. Kini nga mutation sa kdr naghatag og resistensya sa pyrethroids ug DDT ug nakit-an kaniadto sa An. Ang mga populasyon sa stephensi nga nakolekta sa India kaniadtong 2016 ug Afghanistan kaniadtong 2018.31,32 Bisan pa sa ebidensya sa kaylap nga pagsukol sa pyrethroid sa duha nga mga lungsod, ang mutation sa kdr L1014F wala makit-an sa mga populasyon sa Mangalore ug Bangalore nga gisusi dinhi. Ang ubos nga proporsiyon sa mga Etiopianhong isolates nga nagdala niini nga SNP nga heterozygous nagsugyot nga ang mutation mitungha bag-o lang niini nga populasyon. Gisuportahan kini sa usa ka miaging pagtuon sa Awash nga wala’y nakit-an nga ebidensya sa mutation sa kdr sa mga sample nga nakolekta sa tuig sa wala pa ang gi-analisar dinhi.18 Giila namon kaniadto kini nga mutation sa kdr L1014F sa mubu nga frequency sa usa ka set sa mga sample gikan sa parehas nga rehiyon / tuig gamit ang usa ka amplicon detection approach. ang pagbag-o maoy responsable niining naobserbahang phenotype.
Ang limitasyon sa kini nga pagtuon mao ang kakulang sa phenotypic data sa pagtubag sa insecticide. Ang dugang nga mga pagtuon nga naghiusa sa tibuok genome sequencing (WGS) o gipunting nga amplicon sequencing sa kombinasyon sa susceptibility bioassays gikinahanglan aron masusi ang epekto niini nga mutasyon sa insecticide response. Kini nga mga nobela nga missense SNPs nga mahimong adunay kalabotan sa pagsukol kinahanglan nga ipunting alang sa high-throughput molecular assays aron suportahan ang pag-monitor ug mapadali ang functional nga trabaho aron masabtan ug ma-validate ang mga potensyal nga mekanismo nga adunay kalabotan sa mga phenotypes sa resistensya.
Sa katingbanan, kini nga pagtuon naghatag ug mas lawom nga pagsabot sa Anopheles mosquito population genetics sa tibuok kontinente. Ang pag-aplikar sa tibuok genome sequencing (WGS) analysis sa mas dagkong cohorts sa sample sa lain-laing geographic nga mga rehiyon maoy yawe sa pagsabot sa gene flow ug pag-ila sa mga marker sa insecticide resistance. Kini nga kahibalo makahimo sa mga awtoridad sa panglawas sa publiko sa paghimo sa nahibal-an nga mga pagpili sa pag-monitor sa vector ug paggamit sa insecticide.
Gigamit namo ang duha ka pamaagi aron mahibal-an ang kalainan sa numero sa kopya niini nga dataset. Una, migamit kami og coverage-based approach nga naka-focus sa giila nga CYP gene clusters sa genome (Supplementary Table S5). Ang sampol nga coverage gi-average sa mga lokasyon sa pagkolekta ug gibahin sa upat ka grupo: Ethiopia, Indian fields, Indian colonies, ug Pakistani colonies. Ang coverage alang sa matag grupo gi-normalize gamit ang kernel smoothing ug dayon giplano sumala sa median genome coverage depth alang sa maong grupo.


Oras sa pag-post: Hun-23-2025